Thème: open science

«Certaines des bases de données les plus connues, telles que Web of Science et Scopus, sont propriétaires et offrent un accès payant aux données et aux services qui soutiennent ces mesures et d’autres, notamment les classements des universités et les facteurs d’impact des revues. Mais dans la récente Déclaration de Barcelone, plus de 30 organismes de recherche et de financement appellent la communauté à s’engager en faveur de plateformes gratuites pour tous, plus transparentes quant à leurs méthodes et sans restrictions quant à l’utilisation des données.»

L’université de la Sorbonne, qui a mis fin à son abonnement au Web of Science l’année dernière et a opté pour une plateforme ouverte plus récente appelée OpenAlex, et la journaliste du journal [propriétaire] Science Catherine Offord souligne que «certains experts s’interrogent sur leur qualité par rapport aux bases de données propriétaires à ce stade.»

La sécurité de la recherche est un sujet de plus en plus sensible en Europe. Slaven Misljencevic, chargé de mission à la direction de la recherche de la Commission européenne, déclare: «Depuis la fin de l’année 2019 […] nous avons observé un nombre croissant de cas d’ingérence étrangère ciblant les établissements d’enseignement supérieur et les organismes de recherche de l’UE. […] C’était relativement nouveau parce qu’à l’époque, il était question de science ouverte et d’ouverture sur le monde. Soudain, nous avons été confrontés à un problème qui a peut-être été facilité par cette ouverture.» En 2021, la Commission européenne a proposé une nouvelle approche de la coopération internationale en matière de recherche et d’innovation. En janvier 2022, elle a publié des lignes directrices sur l’ingérence étrangère dans la recherche de l’UE, qui définissent des mesures sur la manière dont les établissements d’enseignement supérieur et les organismes de recherche peuvent identifier et traiter les risques d’ingérence étrangère.

La Commission travaille sur des recommandations qui visent, pour la première fois en Europe, une définition commune du problème de la coopération internationale en matière de recherche, selon le principe directeur «ouvert là où c’est possible, fermé là où c’est nécessaire».

La coopération ouverte doit rester l’option par défaut de l’Europe en matière de collaboration internationale dans le domaine de la recherche, malgré la situation géopolitique difficile actuelle, juge l’Association européenne de l’université (EUA). «L’Europe reste «assez ouverte», mais on a le sentiment que «les choses pourraient devenir beaucoup plus fermées»», déclare Thomas Jørgensen, directeur de la coordination des politiques et de la prospective à l’EUA

«Ces derniers mois, les discussions consacrées au renouvellement de la licence nationale Elsevier n’ont pas abouti. A défaut d’avoir obtenu un accord conforme à son mandat de négociation, Swissuniversities joue les prolongations. […] Un blocage similaire ankylose les négociations entre le Consortium des bibliothèques universitaires suisses et la maison Taylor & Francis. […] Aujourd’hui, l’association [swissuniversities] essaie de tendre vers un modèle de licence qui se concentre sur l’aspect «Publish», et non plus des licences hybrides «Read & Publish». Le but ultime étant de pouvoir publier les articles de leurs chercheurs en libre accès dans la totalité des revues du portefeuille des maisons d’édition – celles-ci étant plus réticentes à ouvrir l’accès dans leurs revues les plus prestigieuses.»

«L’Ecole polytechnique fédérale de Lausanne (EPFL) […] vient de lancer un nouveau centre, qui se fixe deux objectifs initiaux: coordonner tous les travaux de recherche en cours dans [le] domaine [de l’IA] sur le campus, mais aussi contribuer à la création de systèmes d’IA plus sûrs». Ce centre sera codirigé par deux professeurs de l’EPFL, Pascal Frossard, de la Faculté des sciences et techniques de l’ingénieur, et Marcel Salathé, de la Faculté informatique et communications, et de la Faculté des sciences de la vie».

Monsieur Salathé explique que le premier pas sera de «cartographier tout ce que fait l’EPFL sur le terrain de l’intelligence artificielle […], [puisqu’]il est important que tout le monde soit au courant des projets sur le campus afin de permettre une collaboration optimale». Le professeur souhaite aussi «intensifier [leur] collaboration avec le secteur public» et davantage d’implication en open source.

Dritjon Gruda, Professeur adjoint en comportement organisationnel à l’Université nationale d’Irlande à Maynooth, raconte les défis rencontrés lorsqu’on soumet un article à une revue. Pendant la pandémie de COVID-19 il a soumis, avec ses collègues, «un article à une revue de premier plan dans [leur] domaine […]. Il s’agissait d’un article urgent, car les gens commençaient à s’adapter au fur et à mesure que la pandémie s’accélérait. L’article est resté en suspens pendant plusieurs mois sans même être soumis à un examen par les pairs. Les nombreux courriels envoyés à la revue n’ont rien donné. [Ils ont] dû retirer l’article et le soumettre ailleurs, perdant ainsi un temps précieux. Cette situation aurait pu être évitée [s’ils avaient] été autorisés à soumettre le manuscrit ailleurs simultanément».

En effet, il est interdit de soumettre simultanément un article à plusieurs revues. Monsieur Gruda explique néanmoins que cette interdiction «semble dépassée et, parfois, grossièrement injuste». Selon lui, la numérisation permet aujourd’hui de pouvoir  adapter les normes de l’édition «aux besoins et au rythme de la recherche contemporaine». En effet, l’interdiction entrave non seulement la carrière des chercheur·es, mais aussi «la rapidité de la diffusion scientifique, un facteur crucial dans de nombreux domaines tels que la science du climat, la santé et la médecine, où le partage des connaissances en temps opportun est primordial. La prolifération rapide des articles préimprimés lors de la pandémie de COVID-19 a démontré les avantages d’un partage rapide de l’information, même si ces articles n’ont pas encore été examinés par des pairs».

Basée à Davos, la start-up AlpineAI veut proposer une alternative à ChatGPT et créér SwissGPT, qui, contrairement à ChatGPT, «doit permettre de retracer la source du résultat produit». AlpineAI est une société créée «par des représentants de plusieurs laboratoires de recherche sur l’IA, dont ceux de l’Université de Zurich, de l’EPFZ et de la Haute Ecole zurichoise des sciences appliquées (ZHAW)».

Rassemblant une grande quantité de données, de livres, de revues, d’images et de supports numériques, la bibliothèque de l’Ecole Polytechnique Fédérale de Zurich (ETHZ) travaille avec Google Cloud afin de rendre plus accessibles ses ressources en les numérisant. La démarche est entreprise pour rassembler les différentes applications sur une plateforme centrale, Apigee, ainsi que dans un but d’utilisation par le public et de traitement ultérieur. Un véritable «point d’accès central pour les développeurs de la communauté des données ouvertes» explique leur communiqué.

Depuis une quinzaine d’années les scientifiques essaient de surmonter la difficulté de la replicabilité des résultats. Les domaines scientifiques les plus concernés sont la médecine, la biologie et surtout la psychologie. La cause de cette difficulté peut se retrouver d’une part dans les méthodologies inadaptées, et de l’autre dans «la propension des revues à ne publier que des résultats positifs et la culture du «publish or perish»». Pour pallier à cette crise, de nombreuses initiatives ont été mises en place, parmi lesquelles les outils pour une science ouverte (Open Science) ou le rapport enregistré (registered report) qui implique une validation de la recherche avant qu’elle soit menée.

La communauté scientifique doit, selon les auteurs de l’article, Stéphanie Girardclos et Jérôme Kasparian de l’Université de Genève, reprendre le contrôle de ce bien public qu’est le savoir scientifique qu’elle produit, afin de réduire sa dépendance économique vis-à-vis des grandes maisons d’édition et de rendre les articles déjà publiés disponibles de manière permanente. «Pour la Suisse, nous proposons que des institutions telles que le Fonds national suisse, les académies et les hautes écoles forment, avec les sociétés scientifiques, des consortiums qui assument la responsabilité des revues et définissent leur politique de publication en termes de qualité, de droits d’auteur et de politique tarifaire. La mise en œuvre technique peut être déléguée à des éditeurs commerciaux conformément aux normes et exigences actuelles et par le biais d’appels d’offres.»

«Le 8 mars 2023 s’est déroulée à Berne une rencontre organisée par le Secrétariat d’État à la formation, à la recherche et à l’innovation (SEFRI) en collaboration avec les représentants de l’initiative European Open Science Cloud (EOSC). L’objectif de cette rencontre était de continuer à intensifier le dialogue transfrontalier sur la science ouverte (Open Science), d’échanger sur les bonnes pratiques et d’encourager les activités communes entre les acteurs européens et suisses. Martina Hirayama, la secrétaire d’État à la formation, à la recherche et à l’innovation, a souligné l’importance d’un espace de recherche européen ouvert.»

«Les 7 et 8 février, la secrétaire d’État Martina Hirayama s’est rendue à Stockholm (Suède) pour participer à la réunion informelle des ministres des pays de l’Union européenne (UE) chargés de la recherche et de l’innovation. Le principal sujet de cette rencontre politique semestrielle était l’Open Science dans les infrastructures de recherche et les publications – une thématique importante aux yeux de la présidence du Conseil de l’UE, actuellement assumée par la Suède. La Secrétaire d’Etat Hirayama a également eu des discussions bilatérales avec ses homologues d’Allemagne, d’Autriche, du Danemark, d’Espagne et du Portugal, ainsi que d’autres échanges informels. »

«La sphère politique ne se sent pas compétente pour édicter des règles claires en matière de développement de l’intelligence artificielle. Surtout quand celle-ci est utilisée à des fins militaires. Une responsabilité qui repose sur les épaules des chercheurs en Suisse.

[… ] «Les armes autonomes poussent le dilemme entre la recherche libre et les abus possibles à son paroxysme, car on parle ici de vie ou de mort, souligne Marcello Ienca, [chercheur à l’EPFL sur l’éthique des systèmes intelligents].»

«Le FNS adapte ses prescriptions d’Open Access pour se conformer aux principes de la cOAlition S, à laquelle il a adhéré en juin 2022 : dès début 2023, les articles scientifiques devront être publiés en libre accès immédiat»

Nature passe en revue les grands sujets traités par le journal en 2022 comme par exemple:

• La guerre en Ukraine et les conséquences pour la sciences
• Les avancées du mouvement Open Science
• Les conséquences du Brexit
• Des sondages (inquiètantes) sur l’harcèlement de doctorant-es en Suède

Le Conseil National suisse a voté, ce lundi, à l’unanimité un projet d’adhésion de la suisse à six réseaux de recherche européens. Les infrastructures font partie du «Consortium pour une infrastructure européenne de recherche» (ERIC) mis en place par l’Union européenne.

«Au total, 22 réseaux et infrastructures constituent ERIC. Ils contribuent à simplifier la collaboration entre les chercheurs dans des domaines importants pour la société tels que les sciences de l’environnement ou les sciences de la vie, mais aussi à améliorer la comparabilité et la disponibilité des données. La Suisse est actuellement membre à part entière d’un seul de ces réseaux ERIC. Et elle a le statut d’observatrice dans huit autres, a rappelé Céline Weber (PVL/VD) pour la commission. Une adhésion à part entière permettrait à Berne d’avoir un droit de vote et une garantie de participation à long terme.»

«Le CNRS demande désormais à ses chercheurs et chercheuses d’appliquer la stratégie de non-cession des droits d’auteur lors du dépôt de leurs articles auprès d’éditeurs.»

Le 25 août 2022, l’administration du président américain Joe Biden annoncé sa nouvelle politique « d’accès libre » aux recherches financées par des fonds fédéraux. D’ici à la fin de 2025, les agences fédérales devront également mettre gratuitement à la disposition du public les publications des résultats de recherche financées par des fonds publics. Cela met fin à la politique des paywall, qui permet de mettre les articles en mode payant pour la durée d’une année après la publication.

Par ailleurs, les données scientifiques qui sous-tendent les publications évaluées par les pairs doivent également être mises à la disposition du public, à moins que leur partage ne pose des problèmes juridiques, éthiques ou de sécurité. Les données de recherche qui ne donnent pas lieu à des travaux évalués par des pairs doivent, quant à eux, être partagées en interne entre les agences gouvernementales.

Le consortion pour le libre accès Coalition S a appelé la décision «entièrement en accord» avec ses principes et conforme avec les recommandations UNESCO pour le libre accès.

Certains éditeurs et sociétés scientifiques s’opposent cependant à ce changement. Ils maintiennent que l’embargo d’un an est essentiel pour assumer les coûts d’édition et de production.

Les tensions politiques et sécuritaires croissantes entre Pékin et l’Occident ont suscité des appels à une révision du transfert de données génétiques vers la Chine à partir d’une base de données biomédicales contenant l’ADN d’un demi-million de citoyens britanniques.

«Le FNS vient de décider de rejoindre la cOAlition S, la plus grande initiative mondiale d’organismes de financement de la recherche en faveur de l’Open Access (OA). « La recherche repose sur la collaboration. En tant qu’organismes de financement de la recherche, c’est également en collaborant que nous atteindrons au mieux nos objectifs. Le libre accès aux articles scientifiques est l’un de ces objectifs », déclare Matthias Egger, président du Conseil national de la recherche. « La cOAlition S a démontré qu’elle peut être un moteur de ce changement structurel. »

Depuis 2014, le CERN exige que tous les articles de recherche primaire, examinés par des pair-es et émanant d’auteur-es de l’organisation, soient publiés en libre accès.

Dans un communiqué, le CERN annonce d’être sur le point d’honorer pleinement cette politique : En 2021, 93,7 % des 1058 publications des auteurs du CERN ont été publiées en libre accès. «Atteindre un taux de 100% d’OA [libre accès] pour les résultats de recherche du CERN n’est pas simplement une aspiration ; c’est une exigence politique et un élément clé de notre approche holistique de la science ouverte, dont la pratique globale est, selon nous, essentielle à la réalisation de notre mission scientifique.»